Dalam Quality Control, Tunas Agro melakukan pengawasan di semua lini proses produksi. Untuk produksi benih, tahap-tahap yang dilakukan mulai dari persiapan benih induk, persiapan lahan penanaman, proses penanaman, penyilangan, penandaan, panen, pemrosesan benih, pengujian kadar air dan daya tumbuh benih, hingga benih siap dikemas dan dijual. Semua proses dilakukan pengawasan supaya mendapatkan suatu produk benih yang memenuhi standar kualitas yang berlaku yang telah ditetapkan oleh pemerintah.
 

 
Quality Control Tunas Agro juga mempunyai tempat penyimpanan benih yang kondisinya terkontrol. Mulai dari suhu, kelembaban, dan kebersihan yang selalu diawasi secara ketat oleh tenaga yang terlatih dan berpengalaman. Selain sebagai produsen benih tanaman, Tunas Agro juga melakukan pengawasan dan perlakuan yang ketat dalam proses produksi yang dilakukan oleh tenaga-tenaga profesional agar seluruh hasil produksi Tunas Agro dapat memenuhi keinginan pasar.